Актуальность
Медуллярный рак почки (МРП) является редким и агрессивным новообразованием, которое чаще всего встречается при серповидноклеточной анемии (СКА) или гетерозиготном носительстве этой мутации. Большинство пациентов обращаются уже с метастатическим заболеванием, резистентным к стандартной химиотерапии, а потому существует срочная необходимость понимания его молекулярных основ, чтобы можно было предлагать новые виды терапии.
Цель исследования
Определить молекулярные нарушения и онкогенные каскады, приводящие к развитию МРП.
Дизайн, условия и участники исследования
Серия из пяти замороженных лабораторных образцов пациентов с МРП была изучена с помощью профилирования экспрессии генов, сравнительной геномной гибридизации и секвенирования РНК и полного экзома (ПЭС).
Определение результатов и статистический анализ
Данные секвенирования РНК и ДНК были анализированы для выявления слияния генов и соматических мутаций. Мутации слияния генов были валидизированы с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени и флуоресцентной гибридизации in situ. Профилирование экспрессии генов было анализировано с помощью бесконтрольного иерархического кластерного анализа и системы «Анализ обогащения набора генов» (Gene Set Enrichment Analysis, Институт Брода, Кембридж, Массачусетс, США).
Результаты и ограничения
Мы наблюдали инактивацию гена-супрессора опухолевого роста SMARCB1 во всех опухолях. Во всех четырёх случаях, развившихся у пациентов с СКА, мы определили оригинальный механизм межхромосомных сбалансированных транслокаций, нарушающих последовательность SMARCB1 и приводящих тем самым к его инактивации. Профилирование экспрессии генов показало, что МРП имеет общие онкогенные механизмы со злокачественными рабдоидными опухолями детского возраста, которые тоже представляют собой подвид опухолей, характеризующийся дефектом SMARCB1.
Заключение
МРП характеризуется оригинальным механизмом межхромосомных сбалансированных транслокаций, нарушающих последовательность SMARCB1. ПЭС показало, что МРП не демонстрируют больше никаких типичных генетических нарушений и в целом имеют стабильный геном, что подчёркивает онкогенное действие инактивации SMARCB1.
Ключевые слова: серповидноклеточная анемия, медуллярный рак почки, SMARCB1, транслокация.
Balanced Translocations Disrupting SMARCB1 Are Hallmark Recurrent Genetic Alterations in Renal Medullary Carcinomas
By: Julien Calderaro, Julien Masliah-Planchon, Wilfrid Richer, Laetitia Maillot, Pascale Maille, Ludovic Mansuy, Claire Bastien, Alexandre de la Taille, Hélène Boussion, Cécile Charpy, Anne Jourdain, Claire Bléchet, Gaelle Pierron, David Gentien, Laurence Choudat, Christophe Tournigand, Olivier Delattre, Yves Allory and Franck Bourdeaut
- a APHP, Groupe Hospitalier Henri Mondor, Département de Pathologie, Créteil, France
- b INSERM, U955, Institut Mondor de Recherche Biomédicale, Créteil, France
- c Université Paris-Est Créteil, Créteil, France
- d Institut Curie, Unité de Génétique Somatique, Paris, France
- e INSERM U830, Génétique et Biologie des Cancers, Institut Curie, Paris, France
- f SiRIC Institut Curie, Recherche Translationnelle en Oncologie Pediatrique, Paris, France
- g CHU Nancy, Hôpital d’enfants, Service d’Hémato-oncologie pédiatrique, Vandoeuvre les Nancy, France
- h CHU Nancy, Hôpital Brabois, Service d’Anatomie pathologique, Vandoeuvre les Nancy, France
- i APHP, Groupe Hospitalier Henri Mondor, Service d’Urologie, Créteil, France
- j APHP, Groupe Hospitalier Henri Mondor, Service d’Oncologie médicale, Créteil, France
- k CHU Tours, Hôpital Clocheville, Service d’oncologie et d’hématologie pédiatrique, Tours, France
- l CHU Tours, Service d’Anatomie et de cytologie pathologiques, Tours, France
- m Plateforme de Biologie Moléculaire, Département de Recherche Translationnelle, Institut Curie, Centre de Recherche, Paris, France
- n APHP, Hôpital Bichat, Département de Pathologie, Paris, France
- o Institut Curie, Département d’Oncologie Pédiatrique –Adolescents Jeunes Adultes, Paris, France
European Urology, Volume 69 Issue 6, June 2016, Pages 1055-1061
Keywords: Sickle cell disease, Renal medullary carcinoma, , Translocation
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич