Державна установа «Інститут урології АМН України» був заснований 22 червня 1965 р. як науково-дослідний заклад МОЗ України і мав назву «Київський науково-дослідний інститут захворювань нирок та сечовивідних шляхів (урології)».
З 1982 р. він був перейменований на Київський науково-дослідний інститут урології та нефрології. За постановою Президії Академії наук УРСР № 304 від 21.11.1990 р. Інститут увійшов до складу відділення проблем медицини АН УРСР і отримав подвійне підпорядкування – АН УРСР і МОЗ УРСР.
Згідно за Постановою Кабінету Міністрів України за № 211 від 22 березня 1993 р. Інститут переданий в підпорядкування Академії медичних наук України. За наказом Академії медичних наук України за № 12 від 29 вересня 1993 р. затверджена назва Інституту – Інститут урології та нефрології Академії медичних наук України.
Розпорядженням Кабінету Міністрів України від 13 грудня 2001р. за № 562-р Інститут урології та нефрології ліквідовано. Відповідно до Розпорядження Кабінету Міністрів України від 13.12.2001 р. за № 562-р “Про створення Інститутів урології та нефрології” був створений Інститут урології.
Визначними вченими, які працювали в Інституті і створили наукові школи, були: проф. Ю.Г. Єдиний, проф. О.В. Проскура, проф. Л.Б. Полонский, проф. В.С. Карпенко, проф. В.Л. Бялик, проф. О.В. Соколов, проф. С.Д. Голігорський, проф. А.О. Суходольська, проф. Г.П. Колесніков, проф. І.Ф. Юнда, проф. О.В. Терещенко, д-р мед. наук В.С. Гагарінов.
В попередні роки Інститут очолювали професори: Ю.Г.Єдиний (1965-1968), П.М.Федорченко (1968-1969), В.С.Карпенко (1969-1987), з 1987р. Інститутом керує академік НАН та АМН України О.Ф.Возіанов. (Фото 1)