Актуальность
По крайней мере половина пациентов с диагнозом мышечнонеинвазивного рака мочевого пузыря (МНИРМП) переносят рецидив и примерно 15% - прогрессию до мышечноинвазивного или метастатического заболевания. Требуются биомаркеры для наблюдения за заболеванием.
Цель исследования
Разработка тест-систем для наблюдения с использованием геномных вариантов в бесклеточной опухолевой ДНК плазмы и мочи.
Дизайн, условия и участники исследования
Ретроспективное пилотное исследование с включением 377 образцов 12 пациентов с рецидивным или прогрессирующим / метастатическим заболеванием. Применялись три метода секвенирования нового поколения, определялись соматические варианты ДНК в опухолевой ткани, плазме и моче с помощью персонализированных тест-систем с использованием цифровой капельной полимеразной цепной реакции (цкПЦР). Образцы были собраны с 1994 по 2015 гг., с периодом наблюдения до 20 лет.
Определение результатов и статистический анализ
Прогрессирование до мышечноинвазивного или метастатического рака мочевого пузыря; t-тест для данных цкПЦР.
Результаты и ограничения
Мы разработали от одной до шести персонализированных тест-систем на пациента. Пациенты с прогрессирующим заболеванием демонстрировали повышенный уровень опухолевой ДНК в плазме и моче до прогрессии по сравнению с пациентами с рецидивирующим заболеванием (p = 0.032 и 1.3 × 10−6 соответственно). Интересно, что опухолевая ДНК обнаруживалась в плазме и моче пациентов с неинвазивным заболеванием, уже не обнаруживаясь у пациентов, свободных от заболевания. Для каждого пациента наблюдался значительный уровень гетерогенности; это может быть вызвано гетерогенностью опухоли или работы тест-системы.
Заключение
Бесклеточная опухолевая ДНК может быть обнаружена в плазме и моче даже у пациентов с неинвазивным заболеванием, высокий уровень опухолевой ДНК обнаруживается перед прогрессией, особенно в образцах мочи. Персонализированные тест-системы геномных вариантов могут быть полезными для мониторирования заболевания.
Ключевые слова: биомаркер, бесклеточная ДНК, циркулирующая ДНК, капельная цифровая ПЦР, геномный вариант, секвенирование нового поколения, МНИРМП, персонализированный анализ, плазма, моча.
Genomic Alterations in Liquid Biopsies from Patients with Bladder Cancer
By: Karin Birkenkamp-Demtröder, Iver Nordentoft, Emil Christensen, Søren Høyer, Thomas Reinert, Søren Vang, Michael Borre, Mads Agerbæk, Jørgen Bjerggaard Jensen, Torben F. Ørntoft and Lars Dyrskjøt
- a Department of Molecular Medicine, Aarhus University Hospital, Aarhus N, Denmark
- b Department of Pathology, Aarhus University Hospital, Aarhus C, Denmark
- c Department of Urology, Aarhus University Hospital, Aarhus N, Denmark
- d Department of Oncology, Aarhus University Hospital, Aarhus C, Denmark
European Urology, Volume 70 Issue 1, July 2016, Pages 75-82
Keywords: Biomarker, Cell-free DNA, Circulating DNA, Droplet digital PCR, Genomic variant, Next-generation sequencing, NMIBC, Personalised analysis, Plasma, Urine
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич